"Alphafold 3: revolutionieren molekulare Struktur und Interaktionsvorhersage"

Seit seiner Einführung im Jahr 2020 haben sich über 2 Millionen Forscher Alphafold 2 von Google Deepmind zu den Proteinstrukturen gewandt, die in Durchbrüchen wie Impfstoffentwicklung und Krebsbehandlungen unterstützt werden. Dieses Modell nahm eine Herausforderung an, die Wissenschaftler seit über einem halben Jahrhundert verblüfft hatte. Aber das Team von Google DeepMind hat hier nicht aufgehört. Anstatt sich auf ihren Lorbeeren auszuruhen, rollten sie die Ärmel hoch und begannen an Alphafold 3 zu arbeiten.

Alphafold 3 wurde im Mai von Google DeepMind und isomorphen Labors gestartet und nimmt die Dinge ein. Es prognostiziert nicht nur die Proteinfaltung; Es prognostiziert auch die Struktur und Wechselwirkungen aller Arten von Lebensmolekülen, einschließlich DNA, RNA und Liganden - die winzigen Moleküle, die sich an Proteine ​​befinden.

"Mit Alphafold 2 haben wir große Fortschritte bei der Lösung des Proteinfaltungsrätsels unternommen, aber die wissenschaftliche Gemeinschaft hat sich zu komplexeren Dingen übergegangen", erklärt Jonas Adler, Forschungswissenschaftler bei Google DeepMind. "Die Forscher tauchen nun in Details ein, wie kleine Moleküle binden oder wie RNA funktioniert, Bereiche, in denen Alphafold 2 zu kurz gekommen ist. Um mit dem neuesten Biologie und Chemie Schritt zu halten, brauchten wir ein Tool, das alle Arten von Biomolekülen bewältigen konnte."

"Alles" hier enthält Liganden, die entscheidend sind, weil sie etwa die Hälfte aller Drogen ausmachen. "Bei isomorphen Labors sehen wir das enorme Potenzial von Alphafold 3 für die Gestaltung von Medikamenten rational und setzen es bereits jeden Tag an", sagt Adrian Stecula, Forschungsleiter bei isomorphen Labors. "Wir untersuchen, wie neue kleine Moleküle an neue Arzneimittelziele binden, herausfinden, wie Proteine ​​mit DNA und RNA interagieren, und untersuchen, wie chemische Verbesserungen die Proteinstrukturen beeinflussen - das neue Modell eröffnet all diese Möglichkeiten."

Durch die Einbeziehung dieser zusätzlichen Molekültypen zu handeln, bedeutete der Umgang mit einer Tonne mehr Kombinationen. "Proteine ​​sind ziemlich unkompliziert; es gibt nur 20 Standard -Aminosäuren", bemerkt Jonas. "Aber kleine Moleküle? Sie sind überall mit endlosen Möglichkeiten. Sie sind super unterschiedlich."