"Alphafold 3: Revolucionando a estrutura molecular e a previsão de interação"

Desde o seu lançamento em 2020, mais de 2 milhões de pesquisadores se voltaram para o Alphafold 2 do Google Deepmind para prever estruturas de proteínas, ajudando em avanços como desenvolvimento de vacinas e tratamentos contra o câncer. Esse modelo enfrentou um desafio que perseguiu os cientistas por mais de meio século. Mas a equipe do Google Deepmind não parou por aí; Em vez de descansar sobre os louros, eles enrolaram as mangas e começaram a trabalhar no Alphafold 3.

Lançado em maio pelo Google Deepmind e Laboratórios Isomórficos, o AlphaFold 3 levanta as coisas. Não prevê apenas o dobramento de proteínas; Também prevê a estrutura e as interações de todos os tipos de moléculas da vida, incluindo DNA, RNA e ligantes - aquelas moléculas minúsculas que se ligam às proteínas.

"Com o Alphafold 2, fizemos grandes avanços na solução do quebra -cabeça dobrável de proteínas, mas a comunidade científica passou a coisas mais complexas", explica Jonas Adler, cientista de pesquisa do Google DeepMind. "Os pesquisadores agora estão mergulhando em detalhes, como a seleção de pequenas moléculas ou como o RNA funciona, áreas onde o Alphafold 2 ficou aquém. Para acompanhar as últimas novidades em biologia e química, precisávamos de uma ferramenta que pudesse lidar com todos os tipos de biomoléculas".

"Everything" aqui inclui ligantes, que são cruciais porque representam cerca de metade de todas as drogas. "Nos laboratórios isomórficos, estamos vendo o enorme potencial do Alphafold 3 para projetar medicamentos racionalmente, e já estamos usando todos os dias", diz Adrian Stecula, líder de pesquisa da Isomorphic Labs. "Estamos explorando como novas moléculas pequenas se ligam a novos alvos de medicamentos, descobrindo como as proteínas interagem com o DNA e o RNA e estudando como os ajustes químicos afetam as estruturas de proteínas - o novo modelo abre todas essas possibilidades".

A incorporação desses tipos de moléculas extras significava lidar com uma tonelada de mais combinações. "As proteínas são bem diretas; existem apenas 20 aminoácidos padrão", observa Jonas. "Mas pequenas moléculas? Eles estão em todo lugar, com infinitas possibilidades. Eles são super diversos".