Альфафолд 3: прогнозирование структур и взаимодействий всех молекул всех жизненных молекул
Внутри каждой клетки растения, животного и человека существует оживлённый мир молекулярных машин. Эти машины, состоящие из белков, ДНК и других молекул, не работают в одиночку. Только понимая их взаимодействия в бесчисленных комбинациях, мы можем по-настоящему постичь суть процессов жизни.
В недавно опубликованной статье в *Nature* мы представили AlphaFold 3, революционную модель, которая предсказывает структуру и взаимодействия всех молекул жизни с беспрецедентной точностью. Когда речь заходит о том, как белки взаимодействуют с другими типами молекул, AlphaFold 3 демонстрирует улучшение как минимум на 50% по сравнению с существующими методами. Для некоторых ключевых взаимодействий мы даже удвоили точность наших предсказаний.
Мы воодушевлены потенциалом AlphaFold 3 изменить наше понимание биологии и ускорить разработку лекарств. Учёные теперь могут бесплатно использовать большинство его возможностей через наш недавно запущенный AlphaFold Server, удобный инструмент для исследований. Isomorphic Labs уже сотрудничает с фармацевтическими компаниями, чтобы применить AlphaFold 3 к реальным задачам проектирования лекарств, стремясь разработать новые методы лечения, которые могут изменить жизни.
AlphaFold 3 опирается на успех AlphaFold 2, который в 2020 году преобразовал предсказание структуры белков. С тех пор миллионы исследователей по всему миру использовали AlphaFold 2 для прорывов в таких областях, как вакцины против малярии, лечение рака и дизайн ферментов. AlphaFold был процитирован более 20 000 раз и отмечен многочисленными наградами, включая Breakthrough Prize in Life Sciences. С AlphaFold 3 мы расширяем наше внимание за пределы белков на широкий спектр биомолекул, открывая возможности для ещё более революционной науки — от разработки устойчивых материалов и выносливых культур до ускорения проектирования лекарств и исследований в области геномики.
7PNM - Спайковый белок вируса простуды (Coronavirus OC43): Прогноз структуры AlphaFold 3 для спайкового белка (синий) вируса простуды при взаимодействии с антителами (бирюзовый) и простыми сахарами (жёлтый) точно соответствует истинной структуре (серый). Анимация показывает взаимодействие белка с антителом, затем с сахаром. Продвижение наших знаний о таких процессах иммунной системы помогает лучше понять коронавирусы, включая COVID-19, открывая возможности для улучшенных методов лечения.
Как AlphaFold 3 раскрывает молекулы жизни
----------------------------------------
По заданному списку молекул AlphaFold 3 создаёт их совместную 3D-структуру, показывая, как они сочетаются. Она может моделировать крупные биомолекулы, такие как белки, ДНК и РНК, а также меньшие молекулы, или лиганды, включая многие лекарства. Кроме того, AlphaFold 3 может предсказывать химические модификации этих молекул, которые имеют решающее значение для здорового функционирования клеток и могут привести к заболеваниям при нарушении.
Сила AlphaFold 3 обусловлена её продвинутой архитектурой и обучением, которые теперь охватывают все молекулы жизни. В основе лежит улучшенная версия нашего модуля Evoformer, архитектуры глубокого обучения, обеспечившей успех AlphaFold 2. После обработки входных данных AlphaFold 3 использует диффузионную сеть, схожую с теми, что используются в генераторах изображений AI, для сборки своих предсказаний. Этот процесс начинается с облака атомов и постепенно уточняется до наиболее точной молекулярной структуры.
Прогнозы AlphaFold 3 о молекулярных взаимодействиях точнее, чем у любой существующей системы. Как единая модель, которая целостно вычисляет целые молекулярные комплексы, она уникально позиционирована для объединения научных открытий.
7R6R - Белок, связывающий ДНК: Прогноз AlphaFold 3 для молекулярного комплекса с белком (синий), связанным с двойной спиралью ДНК (розовый), почти идеально соответствует истинной молекулярной структуре, обнаруженной в результате трудоёмких экспериментов (серый).
Лидерство в разработке лекарств в Isomorphic Labs
-----------------------------------------
AlphaFold 3 открывает новые возможности для проектирования лекарств, предсказывая, как молекулы, часто используемые в лекарствах, такие как лиганды и антитела, взаимодействуют с белками, влияя на здоровье и болезни человека.
AlphaFold 3 достигает непревзойдённой точности в предсказании взаимодействий, подобных лекарственным, включая связывание белков с лигандами и взаимодействие антител с целевыми белками. Она на 50% точнее лучших традиционных методов по бенчмарку PoseBusters и не требует структурной информации для начала. Это делает AlphaFold 3 первой системой AI, превосходящей физические инструменты для предсказания биомолекулярных структур. Понимание связывания антител с белками имеет решающее значение для понимания иммунного ответа человека и для разработки новых антител, которые всё более важны в медицине.
Isomorphic Labs использует AlphaFold 3 вместе с другими внутренними моделями AI для улучшения проектирования лекарств как для внутренних проектов, так и для сотрудничества с фармацевтическими партнёрами. Этот подход помогает нам решать новые цели заболеваний и находить инновационные способы решения существующих, которые ранее были недостижимы.
AlphaFold Server: Бесплатный и простой в использовании инструмент для исследований
------------------------------------------------------
8AW3 - Белок, модифицирующий РНК: Прогноз AlphaFold 3 для молекулярного комплекса с белком (синий), нитью РНК (фиолетовый) и двумя ионами (жёлтый) близко соответствует истинной структуре (серый). Этот комплекс связан с созданием других белков — клеточным процессом, фундаментальным для жизни и здоровья.
Недавно запущенный Google DeepMind AlphaFold Server — это самый точный в мире инструмент для предсказания того, как белки взаимодействуют с другими молекулами в клетке. Это бесплатная платформа, доступная учёным по всему миру для некоммерческих исследований. Всего несколькими кликами биологи могут использовать AlphaFold 3 для моделирования структур, состоящих из белков, ДНК, РНК и выбранных лигандов, ионов и химических модификаций.
AlphaFold Server помогает учёным генерировать новые гипотезы для проверки в лаборатории, ускоряя их исследования и способствуя инновациям. Наша платформа упрощает создание предсказаний для исследователей, независимо от их доступа к вычислительным ресурсам или экспертизы в машинном обучении.
Экспериментальное предсказание структуры белков может занять столько же времени, сколько докторская диссертация, и стоить целое состояние. Наша предыдущая модель, AlphaFold 2, была использована для предсказания сотен миллионов структур, задача, которая заняла бы сотни миллионов человеко-лет при текущем темпе экспериментальной структурной биологии.
Ответственное распространение возможностей AlphaFold 3
--------------------------------------------
С каждым выпуском AlphaFold мы стремились понять широкое влияние технологии, сотрудничая с исследовательским и безопасностным сообществом. Мы применяем научный подход и провели тщательные оценки, чтобы минимизировать потенциальные риски, одновременно максимизируя пользу для биологии and человечества.
Опираясь на консультации, проведённые для AlphaFold 2, мы теперь привлекли более 50 экспертов в области биобезопасности, исследований и промышленности, а также сторонних специалистов, чтобы оценить возможности и потенциальные риски последовательных моделей AlphaFold. Мы также участвовали в общественных форумах и дискуссиях перед запуском AlphaFold 3.
AlphaFold Server отражает наше стремление делиться преимуществами AlphaFold, включая нашу бесплатную базу данных из 200 миллионов структур белков. Мы расширяем наш бесплатный образовательный онлайн-курс по AlphaFold с EMBL-EBI и сотрудничаем с организациями в странах Глобального Юга, чтобы оснастить учёных инструментами, необходимыми для ускорения внедрения и исследований, особенно в недостаточно финансируемых областях, таких как забытые болезни и продовольственная безопасность. Мы будем продолжать работать с научным сообществом и политиками для ответственной разработки и внедрения технологий AI.
Открытие будущего биологии клеток с помощью AI
------------------------------------------------
7BBV - Фермент: Прогноз AlphaFold 3 для молекулярного комплекса с ферментным белком (синий), ионом (жёлтая сфера) и простыми сахарами (жёлтый) вместе с истинной структурой (серый). Этот фермент обнаружен в почвенном грибе (Verticillium dahliae), который повреждает широкий спектр растений. Понимание того, как этот фермент взаимодействует с растительными клетками, может помочь исследователям разработать более здоровые и устойчивые культуры.
AlphaFold 3 делает биологический мир более чётким. Она позволяет учёным видеть клеточные системы во всей их сложности, через структуры, взаимодействия и модификации. Этот новый взгляд на молекулы жизни раскрывает их взаимосвязанность и помогает понять, как эти связи влияют на биологические функции — например, как работают лекарства, как производятся гормоны и как восстановление ДНК поддерживает наше здоровье.
Влияние AlphaFold 3 и нашего бесплатного AlphaFold Server будет проявляться в том, как они дают учёным возможность ускорять открытия в открытых вопросах биологии и новых областях исследований. Мы только начинаем изучать потенциал AlphaFold 3, и мы воодушевлены тем, что ждёт в будущем.
Обновление от 11 ноября 2024 года: По состоянию на ноябрь 2024 года мы выпустили код и веса модели AlphaFold 3 для академического использования, чтобы способствовать продвижению исследований. Узнайте больше о инструментах AlphaFold.
Связанная статья
Google перезапускает функцию искусственного интеллекта "Спрашивайте фотографии" с улучшенными скоростными характеристиками
После временного прекращения тестирования Google возобновляет работу функции поиска "Спроси у фото" в Google Фото с помощью искусственного интеллекта и значительными улучшениями. Эта инновационная фун
Microsoft использует передовые модели Grok 3 от xAI в рамках нового сотрудничества в области ИИ
Ранее в этом месяце мое журналистское расследование *Notepad* раскрыло планы Microsoft по интеграции моделей ИИ Grok Элона Маска, которые теперь получили официальное подтверждение. Сегодня на ежегодно
Apple сотрудничает с Anthropic для разработки инструмента для кодирования с помощью искусственного интеллекта в Xcode
Apple и Anthropic сотрудничают в создании помощника по кодингу на базе искусственного интеллектаПо данным Bloomberg, компания Apple разрабатывает продвинутого помощника по кодингу с искусственным ин
Комментарии (37)
![BenBrown]()
BenBrown
28 июля 2025 г., 4:19:30 GMT+03:00
Mind-blowing how AlphaFold 3 maps out life's molecular dance! 🧬 Curious if this could speed up drug discovery or just make scientists' heads spin with data overload. What's next, predicting my coffee's molecular vibe? 😄
0
![WillPerez]()
WillPerez
28 июля 2025 г., 4:19:05 GMT+03:00
AlphaFold 3 is mind-blowing! Predicting every molecule's structure feels like unlocking the universe’s blueprint. Can’t wait to see how this reshapes drug discovery! 😮
0
![ScottPerez]()
ScottPerez
21 апреля 2025 г., 4:43:42 GMT+03:00
AlphaFold 3 es alucinante! Es como tener un microscopio para el mundo molecular. Me ayuda muchísimo en mis proyectos de biología. Ojalá fuera un poco más rápido, pero aún así, ¡herramienta increíble! 🔬🌿
0
![GaryGonzalez]()
GaryGonzalez
20 апреля 2025 г., 22:26:40 GMT+03:00
AlphaFold 3は驚異的です！生命分子の構造と相互作用を予測するなんて素晴らしいですね。でも、複雑すぎて半分も理解できません。とはいえ、生物学にとっては革命的です。これがどう進化するか楽しみです！🧬
0
![FredWhite]()
FredWhite
20 апреля 2025 г., 12:01:38 GMT+03:00
AlphaFold 3 is mind-blowing! It's amazing how it predicts the structures and interactions of life molecules. But it's so complex, I barely understand half of it. Still, it's a game-changer for biology. Can't wait to see how it evolves! 🧬
0
![GregoryAdams]()
GregoryAdams
20 апреля 2025 г., 2:20:34 GMT+03:00
AlphaFold 3 정말 대단해! 분자 상호작용을 깊이 이해할 수 있어서 생물학 연구에 큰 도움이 돼. 다만 너무 복잡해서 가끔 헷갈릴 때가 있어. 좀 더 쉽게 설명해주면 좋겠어! 🤯🔬
0
Внутри каждой клетки растения, животного и человека существует оживлённый мир молекулярных машин. Эти машины, состоящие из белков, ДНК и других молекул, не работают в одиночку. Только понимая их взаимодействия в бесчисленных комбинациях, мы можем по-настоящему постичь суть процессов жизни.
В недавно опубликованной статье в *Nature* мы представили AlphaFold 3, революционную модель, которая предсказывает структуру и взаимодействия всех молекул жизни с беспрецедентной точностью. Когда речь заходит о том, как белки взаимодействуют с другими типами молекул, AlphaFold 3 демонстрирует улучшение как минимум на 50% по сравнению с существующими методами. Для некоторых ключевых взаимодействий мы даже удвоили точность наших предсказаний.
Мы воодушевлены потенциалом AlphaFold 3 изменить наше понимание биологии и ускорить разработку лекарств. Учёные теперь могут бесплатно использовать большинство его возможностей через наш недавно запущенный AlphaFold Server, удобный инструмент для исследований. Isomorphic Labs уже сотрудничает с фармацевтическими компаниями, чтобы применить AlphaFold 3 к реальным задачам проектирования лекарств, стремясь разработать новые методы лечения, которые могут изменить жизни.
AlphaFold 3 опирается на успех AlphaFold 2, который в 2020 году преобразовал предсказание структуры белков. С тех пор миллионы исследователей по всему миру использовали AlphaFold 2 для прорывов в таких областях, как вакцины против малярии, лечение рака и дизайн ферментов. AlphaFold был процитирован более 20 000 раз и отмечен многочисленными наградами, включая Breakthrough Prize in Life Sciences. С AlphaFold 3 мы расширяем наше внимание за пределы белков на широкий спектр биомолекул, открывая возможности для ещё более революционной науки — от разработки устойчивых материалов и выносливых культур до ускорения проектирования лекарств и исследований в области геномики.
Как AlphaFold 3 раскрывает молекулы жизни ----------------------------------------
По заданному списку молекул AlphaFold 3 создаёт их совместную 3D-структуру, показывая, как они сочетаются. Она может моделировать крупные биомолекулы, такие как белки, ДНК и РНК, а также меньшие молекулы, или лиганды, включая многие лекарства. Кроме того, AlphaFold 3 может предсказывать химические модификации этих молекул, которые имеют решающее значение для здорового функционирования клеток и могут привести к заболеваниям при нарушении.
Сила AlphaFold 3 обусловлена её продвинутой архитектурой и обучением, которые теперь охватывают все молекулы жизни. В основе лежит улучшенная версия нашего модуля Evoformer, архитектуры глубокого обучения, обеспечившей успех AlphaFold 2. После обработки входных данных AlphaFold 3 использует диффузионную сеть, схожую с теми, что используются в генераторах изображений AI, для сборки своих предсказаний. Этот процесс начинается с облака атомов и постепенно уточняется до наиболее точной молекулярной структуры.
Прогнозы AlphaFold 3 о молекулярных взаимодействиях точнее, чем у любой существующей системы. Как единая модель, которая целостно вычисляет целые молекулярные комплексы, она уникально позиционирована для объединения научных открытий.
Лидерство в разработке лекарств в Isomorphic Labs -----------------------------------------
AlphaFold 3 открывает новые возможности для проектирования лекарств, предсказывая, как молекулы, часто используемые в лекарствах, такие как лиганды и антитела, взаимодействуют с белками, влияя на здоровье и болезни человека.
AlphaFold 3 достигает непревзойдённой точности в предсказании взаимодействий, подобных лекарственным, включая связывание белков с лигандами и взаимодействие антител с целевыми белками. Она на 50% точнее лучших традиционных методов по бенчмарку PoseBusters и не требует структурной информации для начала. Это делает AlphaFold 3 первой системой AI, превосходящей физические инструменты для предсказания биомолекулярных структур. Понимание связывания антител с белками имеет решающее значение для понимания иммунного ответа человека и для разработки новых антител, которые всё более важны в медицине.
Isomorphic Labs использует AlphaFold 3 вместе с другими внутренними моделями AI для улучшения проектирования лекарств как для внутренних проектов, так и для сотрудничества с фармацевтическими партнёрами. Этот подход помогает нам решать новые цели заболеваний и находить инновационные способы решения существующих, которые ранее были недостижимы.
AlphaFold Server: Бесплатный и простой в использовании инструмент для исследований
------------------------------------------------------
Недавно запущенный Google DeepMind AlphaFold Server — это самый точный в мире инструмент для предсказания того, как белки взаимодействуют с другими молекулами в клетке. Это бесплатная платформа, доступная учёным по всему миру для некоммерческих исследований. Всего несколькими кликами биологи могут использовать AlphaFold 3 для моделирования структур, состоящих из белков, ДНК, РНК и выбранных лигандов, ионов и химических модификаций.
AlphaFold Server помогает учёным генерировать новые гипотезы для проверки в лаборатории, ускоряя их исследования и способствуя инновациям. Наша платформа упрощает создание предсказаний для исследователей, независимо от их доступа к вычислительным ресурсам или экспертизы в машинном обучении.
Экспериментальное предсказание структуры белков может занять столько же времени, сколько докторская диссертация, и стоить целое состояние. Наша предыдущая модель, AlphaFold 2, была использована для предсказания сотен миллионов структур, задача, которая заняла бы сотни миллионов человеко-лет при текущем темпе экспериментальной структурной биологии.
С каждым выпуском AlphaFold мы стремились понять широкое влияние технологии, сотрудничая с исследовательским и безопасностным сообществом. Мы применяем научный подход и провели тщательные оценки, чтобы минимизировать потенциальные риски, одновременно максимизируя пользу для биологии and человечества.
Опираясь на консультации, проведённые для AlphaFold 2, мы теперь привлекли более 50 экспертов в области биобезопасности, исследований и промышленности, а также сторонних специалистов, чтобы оценить возможности и потенциальные риски последовательных моделей AlphaFold. Мы также участвовали в общественных форумах и дискуссиях перед запуском AlphaFold 3.
AlphaFold Server отражает наше стремление делиться преимуществами AlphaFold, включая нашу бесплатную базу данных из 200 миллионов структур белков. Мы расширяем наш бесплатный образовательный онлайн-курс по AlphaFold с EMBL-EBI и сотрудничаем с организациями в странах Глобального Юга, чтобы оснастить учёных инструментами, необходимыми для ускорения внедрения и исследований, особенно в недостаточно финансируемых областях, таких как забытые болезни и продовольственная безопасность. Мы будем продолжать работать с научным сообществом и политиками для ответственной разработки и внедрения технологий AI.
Открытие будущего биологии клеток с помощью AI
------------------------------------------------
AlphaFold 3 делает биологический мир более чётким. Она позволяет учёным видеть клеточные системы во всей их сложности, через структуры, взаимодействия и модификации. Этот новый взгляд на молекулы жизни раскрывает их взаимосвязанность и помогает понять, как эти связи влияют на биологические функции — например, как работают лекарства, как производятся гормоны и как восстановление ДНК поддерживает наше здоровье.
Влияние AlphaFold 3 и нашего бесплатного AlphaFold Server будет проявляться в том, как они дают учёным возможность ускорять открытия в открытых вопросах биологии и новых областях исследований. Мы только начинаем изучать потенциал AlphaFold 3, и мы воодушевлены тем, что ждёт в будущем.
Обновление от 11 ноября 2024 года: По состоянию на ноябрь 2024 года мы выпустили код и веса модели AlphaFold 3 для академического использования, чтобы способствовать продвижению исследований. Узнайте больше о инструментах AlphaFold.
Google перезапускает функцию искусственного интеллекта "Спрашивайте фотографии" с улучшенными скоростными характеристиками
После временного прекращения тестирования Google возобновляет работу функции поиска "Спроси у фото" в Google Фото с помощью искусственного интеллекта и значительными улучшениями. Эта инновационная фун
Microsoft использует передовые модели Grok 3 от xAI в рамках нового сотрудничества в области ИИ
Ранее в этом месяце мое журналистское расследование *Notepad* раскрыло планы Microsoft по интеграции моделей ИИ Grok Элона Маска, которые теперь получили официальное подтверждение. Сегодня на ежегодно
Apple сотрудничает с Anthropic для разработки инструмента для кодирования с помощью искусственного интеллекта в Xcode
Apple и Anthropic сотрудничают в создании помощника по кодингу на базе искусственного интеллектаПо данным Bloomberg, компания Apple разрабатывает продвинутого помощника по кодингу с искусственным ин
28 июля 2025 г., 4:19:30 GMT+03:00
Mind-blowing how AlphaFold 3 maps out life's molecular dance! 🧬 Curious if this could speed up drug discovery or just make scientists' heads spin with data overload. What's next, predicting my coffee's molecular vibe? 😄
0
28 июля 2025 г., 4:19:05 GMT+03:00
AlphaFold 3 is mind-blowing! Predicting every molecule's structure feels like unlocking the universe’s blueprint. Can’t wait to see how this reshapes drug discovery! 😮
0
21 апреля 2025 г., 4:43:42 GMT+03:00
AlphaFold 3 es alucinante! Es como tener un microscopio para el mundo molecular. Me ayuda muchísimo en mis proyectos de biología. Ojalá fuera un poco más rápido, pero aún así, ¡herramienta increíble! 🔬🌿
0
20 апреля 2025 г., 22:26:40 GMT+03:00
AlphaFold 3は驚異的です！生命分子の構造と相互作用を予測するなんて素晴らしいですね。でも、複雑すぎて半分も理解できません。とはいえ、生物学にとっては革命的です。これがどう進化するか楽しみです！🧬
0
20 апреля 2025 г., 12:01:38 GMT+03:00
AlphaFold 3 is mind-blowing! It's amazing how it predicts the structures and interactions of life molecules. But it's so complex, I barely understand half of it. Still, it's a game-changer for biology. Can't wait to see how it evolves! 🧬
0
20 апреля 2025 г., 2:20:34 GMT+03:00
AlphaFold 3 정말 대단해! 분자 상호작용을 깊이 이해할 수 있어서 생물학 연구에 큰 도움이 돼. 다만 너무 복잡해서 가끔 헷갈릴 때가 있어. 좀 더 쉽게 설명해주면 좋겠어! 🤯🔬
0
